胃肠道（GI）病原体是全球发病率和死亡率的重要原因，会导致腹泻、腹痛、恶心、呕吐和脱水等一系列症状和状况。准确检测这些病原体对于胃肠道感染患者的及时诊断、有效治疗和成功管理至关重要。标本采集在检测和鉴定这些病原体的过程中发挥着关键作用。采集标本的质量和完整性直接影响用于病原体检测的实验室测试的准确性和可靠性。
本综合指南旨在全面了解胃肠道病原体检测标本采集的各个方面，强调适当技术和程序的重要性。该指南涵盖了不同类型的胃肠道病原体，用于检测的各种标本，以及每种标本最有效的采集技术。此外，它还讨论了标本的处理、储存和运输、实验室检测方法、结果解释和感染控制措施。
通过遵循本指南中概述的原则和技术，医疗保健专业人员可以确保准确有效地收集标本，最终导致更准确的诊断和更好的患者结果。该指南也是参与胃肠道病原体检测和研究的研究人员和实验室人员的宝贵资源。
一、胃肠道病原体的类型
胃肠道感染可由多种病原体引起，包括细菌、病毒、寄生虫和真菌。每种类型的病原体都有其独特的特征、传播方式和临床表现。在本节中，我们将概述最常见的胃肠道病原体类型，这将有助于医疗保健专业人员更好地了解标本采集和检测的背景。
A.细菌
细菌性胃肠道感染很常见，可由各种细菌引起。一些最常见的细菌病原体包括大肠杆菌、沙门氏菌、志贺菌、弯曲杆菌和艰难梭菌。这些细菌可导致从轻度胃肠炎到严重的危及生命的疾病，如中毒性巨结肠或败血症等感染。细菌感染通常是通过摄入受污染的食物或水、人与人接触或接触受污染的表面而获得的。
B.病毒
病毒性胃肠道感染，通常被称为病毒性胃肠炎，通常是自限性的，通常没有细菌感染严重。引起胃肠炎的最常见的病毒病原体包括诺如病毒、轮状病毒、腺病毒和星形病毒。这些病毒具有高度传染性，可以通过受污染的食物、水或与感染者的接触迅速传播。疫情经常发生在学校、医院和游轮等封闭环境中。
C.寄生虫
寄生性胃肠道感染可由各种原生动物和蠕虫引起。最常见的原生动物寄生虫包括蓝氏贾第鞭毛虫、隐孢子虫和溶组织内阿米巴，它们通常会导致腹泻、腹痛和其他胃肠道症状。蠕虫或寄生虫，如蛔虫、鞭虫和钩虫，也会感染胃肠道，导致营养不良、贫血和其他并发症。寄生虫感染通常是通过摄入受污染的食物或水、与受感染者接触或接触受污染的土壤而获得的。
D.真菌
真菌性胃肠道感染比细菌、病毒或寄生虫感染更不常见，但在某些人群中，尤其是免疫功能低下的人群中，仍然会导致严重的发病率。念珠菌是真菌性胃肠道感染最常见的原因，通常表现为口腔鹅口疮或食管炎。其他真菌，如曲霉菌或隐球菌，在极少数情况下也会引起胃肠道感染。真菌感染通常是通过摄入受污染的食物或吸入真菌孢子而获得的。
二、胃肠道病原体检测的样本类型
胃肠道病原体的准确检测依赖于标本的适当选择和收集。几种类型的标本可用于检测这些病原体，每种标本都有其特定的优势和局限性。在本节中，我们将讨论检测胃肠道病原体最常用的标本类型。
A.粪便样本
粪便样本是最常收集的胃肠道病原体检测样本，因为它们含有高浓度的病原体。它们对细菌、寄生虫和病毒感染的诊断特别有用。根据疑似病原体的不同，可能需要对粪便样本的不同部分进行分析。例如，细菌病原体通常在粪便的外层发现，而寄生虫更常见于粪便的中心部分。
B.肛拭子样本
肛拭子是检测胃肠道病原体的粪便样本的替代品，尤其是在无法或不实用的情况下。与其他一些采集方法相比，它们的侵入性较小，可以很容易地从包括儿童和婴儿在内的患者身上采集。肛拭子最适合检测细菌和病毒病原体，但可能对检测寄生虫无效，因为寄生虫在直肠样本中的数量通常较低。
C.十二指肠吸出物
十二指肠抽吸包括使用内窥镜从十二指肠（小肠的第一部分）收集液体。这种类型的标本特别适用于诊断小肠细菌过度生长（SIBO）和检测寄生虫，如蓝氏贾第鞭毛虫和隐孢子虫。该手术需要专门的培训和设备，比粪便样本或直肠拭子更具侵入性。
D.组织活检
组织活检包括从胃肠道中取出少量组织样本，通常是在内镜或外科手术过程中。活检对于检测引起局部感染的病原体特别有用，如幽门螺杆菌（引起胃溃疡）或侵袭性真菌感染。组织活检也可用于评估感染引起的组织损伤和炎症的程度，为患者管理提供有价值的信息。
三、采集程序和技术
正确的采集程序和技术对于获得准确可靠的胃肠道病原体检测结果至关重要。在本节中，我们将讨论每种标本类型的具体采集程序，以及采集前的准备步骤。
A.采集前准备
1.患者说明：在采集任何样本之前，必须向患者提供明确的说明。这些说明应包括有关采集过程、采集设备的使用以及可能影响检测结果的任何饮食或药物限制的信息。
2.采集试剂盒和用品：在开始采集过程之前，确保所有必要的采集用品，如无菌容器、拭子和手套，都可用并贴上适当的标签。使用正确的耗材可确保样品的完整性，并将污染风险降至最低。
B.粪便样本采集
1.时间和频率：根据疑似病原体的不同，可能需要多份粪便样本来增加检测的可能性。应在不同的时间和不同的日子采集样本，最好在72小时内采集。
2.收集方法：应指示患者使用干净的一次性勺子或抹刀收集一小部分粪便样本，最好是核桃大小。样品应放置在无菌、防漏的容器中，容器盖应紧密。如果要对样品进行寄生虫检测，可能需要防腐剂或固定剂。
C.肛拭子采集
技术和处理：医护人员应戴上手套，将无菌棉签插入患者肛门约2-3厘米，轻轻旋转以确保与直肠粘膜充分接触。然后应小心取出拭子，避免与肛周皮肤接触，并将其置于无菌运输介质中。
正确的拭子类型选择：对疑似病原体使用合适类型的拭子至关重要。一些拭子是专门为细菌或病毒病原体设计的，而另一些则适用于更广泛的生物体。这里推荐麦瑞科林研发生产的粪便样本采样套装：一种舒适、高效的解决方案，配有粪便拭子、保存溶液、坐垫纸、条形码等物品，质量保证。
D.十二指肠吸出物收集
1.适应症和禁忌症：只有当临床上强烈怀疑小肠细菌过度生长或寄生虫感染，并且其他侵入性较小的测试没有结论时，才应进行十二指肠抽吸。该手术不应在患有某些疾病的患者中进行，如凝血障碍或最近的胃肠道手术。
2.内窥镜手术：医护人员将内窥镜插入患者的口腔，并将其推进十二指肠。然后通过内窥镜插入导管，从十二指肠吸出少量液体。样品应放置在无菌容器中，并尽快运至实验室。
E.组织活检采集
1.适应症和禁忌症：当怀疑有局部胃肠道感染或炎症时，通常会进行组织活检。该手术不应在患有某些疾病的患者中进行，如凝血障碍或最近的胃肠道手术。
2.内镜或外科手术：组织活检可以在内镜手术期间进行，如胃镜或结肠镜检查，也可以在手术期间进行。医疗保健专业人员将使用专用仪器从受影响区域取出少量组织样本。样品应放置在装有适当运输介质的无菌容器中，并尽快送往实验室。
四、试样的搬运、储存和运输
试样的正确处理、储存和运输对于保持其完整性和确保测试结果的准确性至关重要。在本节中，我们将讨论用于胃肠道病原体检测的各种样本类型的处理、储存和运输指南。
A.处理指南
1.在处理标本时，穿戴适当的个人防护装备（PPE），如手套、口罩和护目镜，以最大限度地降低接触传染源的风险并防止污染。
2.最大限度地减少样本采集、处理或运输到实验室之间的时间。这有助于保持病原体的生存能力，并降低竞争生物过度生长的风险。
3.确保所有容器和运输介质安全关闭，并贴上患者信息、采集日期和样本类型的标签。
B.温度和储存条件
1.粪便样本和直肠拭子：大多数细菌和病毒病原体可以在2-8°C下储存长达48小时。然而，某些病原体，如弯曲杆菌，可能需要在较低的温度（例如-20°C）下或在专门的运输介质中储存。寄生虫样本应在室温下储存在防腐剂或固定液中。
2.十二指肠吸出物：将十二指肠吸出物储存在2-8°C的温度下，并在收集后2小时内将其运送到实验室，因为细菌在室温下会迅速过度生长。
3.组织活检：活检标本应在室温下储存在适当的运输介质中，如福尔马林或其他固定剂。不要冷藏或冷冻组织样本，因为这可能会影响样本的质量。
C.运输至实验室
1.采集后尽快将标本运送到实验室，最好在24小时内运送。运输延误可能导致病原体丧失生存能力和样品降解。
2.使用符合当地和国际生物标本运输法规的适当运输容器和包装材料。确保包装防漏，并正确标记必要的患者和样本信息。
3.在运输过程中保持适当的储存温度。对于需要冷藏的样品，使用带冰袋或制冷剂凝胶袋的隔热容器或冷却器。
五、胃肠道病原体检测的实验室检测方法
各种实验室检测方法可用于检测胃肠道病原体。每种方法都有其优点、局限性和具体应用。在本节中，我们将讨论胃肠道病原体检测最常用的实验室检测方法。
A.显微镜
显微镜检查包括在显微镜下检查粪便或其他标本，以确定病原体的存在，如细菌、寄生虫或真菌成分。这项技术对于检测寄生虫特别有用，包括原生动物和蠕虫。然而，显微镜是劳动密集型的，需要熟练的技术人员才能准确识别。
B.基于文化的技术
基于培养的技术包括在专门的培养基上从标本中生长细菌或真菌。这种方法特别适用于细菌病原体的鉴定，并允许进行进一步的测试，如抗菌药物敏感性测试。然而，基于培养的技术通常不适合检测病毒或一些挑剔的生物体。
C.分子诊断（如PCR）
分子诊断，如聚合酶链式反应（PCR），涉及病原体特定核酸序列的扩增和检测。基于PCR的技术具有高度的敏感性和特异性，可以快速准确地检测各种胃肠道病原体，包括细菌、病毒和寄生虫。然而，分子诊断可能更昂贵，并且需要专门的设备和训练有素的人员。
D.抗原检测分析
抗原检测试验涉及对病原体产生的特定抗原（蛋白质或其他分子）的检测。这些测定通常使用酶联免疫吸附测定（ELISA）或免疫色谱技术进行。抗原检测测定可以快速且相对简单，但其灵敏度和特异性可能因病原体和靶向的特异性抗原而异。
E.血清学检测
血清学测试检测宿主在感染特定病原体时产生的抗体的存在。这些测试对于某些病毒或寄生虫感染的诊断尤其有用，例如甲型肝炎或弓形虫病。然而，血清学检测通常对急性胃肠道感染的诊断无效，因为它们可能在感染的早期阶段检测不到抗体的存在。
六、实验室结果解释
解释胃肠道病原体检测的实验室结果需要彻底了解所使用的检测方法、临床背景和每次检测的局限性。在本节中，我们将讨论在解释实验室结果时需要考虑的因素以及临床相关性的重要性。
A.检测方法的敏感性和特异性
每种实验室检测方法都有其固有的敏感性和特异性，这会影响对结果的解释。高度敏感的检测更有可能检测到真正的阳性病例，而高度特异的检测更有助于正确识别真正的阴性病例。在解释结果时，必须考虑检测方法的敏感性和特异性，因为可能会出现假阳性和假阴性。
B.病原体的流行率
特定胃肠道病原体在特定人群或地理区域的流行率也会影响实验室结果的解释。在特定病原体高度流行的地区，阳性检测结果更有可能是真正的阳性。相反，在病原体罕见的地区，阳性检测结果可能更可能是假阳性。
C.临床背景和患者病史
实验室结果应始终根据患者的临床表现、病史和风险因素进行解释。阳性的实验室结果并不一定表明是活动性感染，因为一些检测可能会检测到不活的生物体或先前感染的残余物。同样，阴性结果并不总是排除感染的可能性，尤其是在检测灵敏度有限的情况下，或者在样本收集或处理不当的情况下。
D.验证性测试
在某些情况下，为了确定最终诊断，可能需要进行验证性测试。这可能包括重复初始测试，使用替代测试方法，或测试额外的样本。当初始测试结果与患者的临床表现不一致时，或者当测试的敏感性或特异性有限时，验证性测试尤为重要。
E.与实验室的沟通
医疗保健提供者和实验室之间的密切沟通对于准确解释实验室结果至关重要。医疗保健提供者应提供相关的临床信息，如患者病史、旅行史和暴露风险，以帮助指导实验室的检测方法。反过来，实验室应传达与检测方法或收到的样本质量有关的任何担忧或限制。
七、预防和感染控制措施
感染控制措施在防止胃肠道病原体在医疗机构和社区内传播方面发挥着至关重要的作用。通过实施适当的感染控制措施，医疗保健专业人员可以将传播风险降至最低，并保护弱势群体。在本节中，我们将讨论胃肠道病原体的关键感染控制措施。
A.手部卫生
手部卫生是预防胃肠道病原体传播的最关键的感染控制措施。医疗保健专业人员应遵守适当的手部卫生习惯，包括在患者接触前后、处理标本后和使用洗手间后用肥皂和水洗手或使用含酒精的洗手液。
B.个人防护装备（PPE）
医疗保健专业人员在采集标本或处理受污染材料时，应穿戴适当的个人防护装备，如手套、口罩和护目镜。应移除并适当处置个人防护用品，以将传播风险降至最低。
C.环境清洁和消毒
定期清洁和消毒医疗环境中的表面和设备对于降低胃肠道病原体传播的风险至关重要。应特别注意高接触表面和收集、处理或储存胃肠道标本的区域。
D.隔离注意事项
疑似或确诊胃肠道感染的患者应接受适当的隔离预防措施，以最大限度地降低传播给其他患者和医护人员的风险。隔离预防措施可能包括接触预防措施、私人房间或与类似感染的患者共同居住。
E.教育和培训
医疗保健专业人员应接受持续的感染控制措施教育和培训，包括手部卫生、个人防护用品的使用和样本处理。定期培训有助于确保工作人员了解当前的最佳做法，并遵守建议的指导方针。
F.监测和疫情管理
医疗机构应建立监测系统，以监测胃肠道感染的发生率并识别潜在的疫情。早期发现和及时干预对于控制疫情和防止进一步传播至关重要。疫情管理可能包括加强感染控制措施、有针对性的检测以及与公共卫生当局的沟通。
八、结论
胃肠道病原体的检测和管理需要多方面的方法，包括适当的标本采集、处理和运输，以及利用各种实验室检测方法。全面了解每种检测方法的优点和局限性，并仔细解释实验室结果，对于准确诊断和治疗至关重要。此外，实施感染控制措施、推广预防策略、参与公共卫生干预和社区教育，对于减轻个体患者和更广泛社区的胃肠道感染负担至关重要。通过遵循最佳实践并与实验室和公共卫生专业人员合作，医疗保健提供者可以为控制和预防胃肠道感染的持续努力做出贡献，最终改善人群的整体健康和福祉。
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